ここには、当館所蔵の公文書を、その作成機関によって分け、おおよそ年代の古い順に掲載しました。
リンクが設定されている文字列から各記事に遷移します。
各記事では、文書群名（または所蔵機関名）・資料の概要・年代・点数（概数)を記載し、最後に資料名を何点か例示しました。また、フィルムなどで所蔵する複製資料については、原本を所蔵している機関名を補記しました。
幕府文書（松前奉行所文書、箱館奉行所文書）
箱館裁判所・箱館府（箱館県）文書
藩・県文書
開拓使文書（ 樺太開拓使文書、大蔵省開拓使会計残務整理委員文書を含む）
函館裁判所文書
函館税関文書
三県文書
工部省文書
農商務省及び同省北海道事業管理局文書
北海道庁文書
北海道会文書
樺太庁文書
宮内省御料局（帝室林野局）文書
内閣文書
内務省文書
北海道文書
北海道教育委員会文書
道内市町村関係文書
その他
北海道立文書館所蔵資料紹介～公文書 国―その他の機関
追加情報
箱館裁判所文書・箱館府文書・開拓使文書・樺太開拓使文書などのうち、約4200冊については解読原稿が作成されています。
箱館奉行所文書・開拓使文書の一部については、原本のほかにマイクロ複製資料があります。
